일본복음선교회 (Japan Evangelical Mission)는 1991년에 시작되어 100여 명의 선교사를 배출한 파송선교단체로 국내 유일의 전문적인 일본선교훈련인 MJTC(Mission Japan Training Course)를 통해서 선교 동원과 훈련 사역을 하고 있으며, 파송된 선교사들의 후원 및 관리를 통해 일본에 선교하는 복음주의적인 초교파 전문선교단체입니다.

일본선교훈련원과 국내 동원사역, 그리고 일본 현지의 교회개척과 현지교회 협력 등을 주 사역으로 하고 있으며, 이를 위해서 매주 목요일마다 일본어예배와 선교모임, 그리고 매년 단기선교여행과 일본선교세미나를 통해 일본선교의 필요성을 알리고 있습니다.

JEM은 선교한국(MK), 한국세계선교협의회(KWMA) 가입단체입니다.